7月1號起，環保署「衛生紙丟馬桶」政策上路，鼓勵所有公家機關把衛生紙丟入馬桶。清大部分行政大樓已張貼「請將衛生紙丟入馬桶」公告，不過有些舊公告「請勿將衛生紙丟入馬桶，以免造成阻塞」的文宣卻還沒撕除，成為「一所兩制」現象。
有同學反應，在許多住宿區，如仁實齋，廁所門上張貼「勿將衛生紙丟入馬桶」公告，但至行政大樓如廁時，又看見「請將衛生紙丟入馬桶」公告，讓學生不禁產生疑問，新政策是校區全部落實，還是部份落實？如沒張貼任何公告之廁所，要把衛生紙丟入馬桶還是垃圾桶？
對於出現「要丟馬桶」和「勿丟馬桶」兩種公告打架的狀況，校園規劃室劉興淦主任表示，為因應國家政策、整潔環境，校規室鼓勵學生把衛生紙丟入馬桶，如遇堵塞問題，再請校方處理。
然而學生會提出疑問，如馬桶會出現堵塞問題，便不應該開放衛生紙入馬桶，否則馬桶堵塞的問題還得由學生承受；校園規劃室回應，自7月起便是校園管線轉換期，如遇馬桶不斷堵塞，將在短時間內改善管道，確保「衛生紙入馬桶」政策可順利執行，同時也強調，大部分馬桶堵塞問題為非衛生紙物品堵塞所致，呼籲勿將衛生棉等物品丟入馬桶，包括非水溶性之面紙。
住宿組回答相對保守，表示將在短時間內討論出宿舍管線方案，評估各齋馬桶堵塞可能性，對於這段時間學生如廁方式，建議廁所有公告者，遵循公告，未公告者，可自行決定。